Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID1Q9ULK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRID1Q9ULK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRID1Q9ULK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms