Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTS1Q9ULC4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTS1Q9ULC4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTS1Q9ULC4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms