Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH7Q9ULB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH7Q9ULB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH7Q9ULB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms