Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC13A4Q9UKG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC13A4Q9UKG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC13A4Q9UKG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms