Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD1Q9UIS9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD1Q9UIS9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD1Q9UIS9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD1Q9UIS9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms