Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN4Q9UHM6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN4Q9UHM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN4Q9UHM6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms