Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHORDC1Q9UHD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHORDC1Q9UHD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHORDC1Q9UHD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms