Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF20Q9UGU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCF20Q9UGU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCF20Q9UGU0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF20Q9UGU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms