Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT8Q9UFF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT8Q9UFF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms