Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1BQ9P298 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1BQ9P298 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1BQ9P298 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1BQ9P298 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms