Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA8Q9NY65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA8Q9NY65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA8Q9NY65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms