Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED29Q9NX70 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED29Q9NX70 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED29Q9NX70 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms