Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX05

FAM120C, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120CQ9NX05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM120CQ9NX05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM120CQ9NX05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM120CQ9NX05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM120CQ9NX05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM120CQ9NX05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms