Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM248Q9NWD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM248Q9NWD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM248Q9NWD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms