Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL11Q9NVR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL11Q9NVR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL11Q9NVR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms