Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms