Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC3Q9NQT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC3Q9NQT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC3Q9NQT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC3Q9NQT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms