Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPAG4Q9NPE6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG4Q9NPE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG4Q9NPE6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPAG4Q9NPE6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG4Q9NPE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms