Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
XAB2Q9HCS7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XAB2Q9HCS7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XAB2Q9HCS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms