Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRPV4Q9HBA0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV4Q9HBA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV4Q9HBA0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPV4Q9HBA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms