Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCSQ9HAB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPCSQ9HAB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPCSQ9HAB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPCSQ9HAB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms