Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVMER34-1Q9H9K5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVMER34-1Q9H9K5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms