Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUBCNLQ9H714 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUBCNLQ9H714 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNLQ9H714 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNLQ9H714 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms