Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
YTHDC2Q9H6S0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
YTHDC2Q9H6S0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC2Q9H6S0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
YTHDC2Q9H6S0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
YTHDC2Q9H6S0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
YTHDC2Q9H6S0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms