Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OPA3Q9H6K4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OPA3Q9H6K4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms