Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2DQ9H6A0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2DQ9H6A0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2DQ9H6A0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms