Protein–RNA interactions for Protein: Q9H251

CDH23, Cadherin-23, humanhuman

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23Q9H251 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH23Q9H251 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH23Q9H251 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDH23Q9H251 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH23Q9H251 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms