Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3FQ9H1D9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3FQ9H1D9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3FQ9H1D9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3FQ9H1D9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3FQ9H1D9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3FQ9H1D9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3FQ9H1D9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3FQ9H1D9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms