Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAIP1Q9H074 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAIP1Q9H074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAIP1Q9H074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAIP1Q9H074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAIP1Q9H074 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAIP1Q9H074 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAIP1Q9H074 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAIP1Q9H074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms