Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM54Q9BYV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM54Q9BYV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM54Q9BYV2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms