Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC2Q9BYS8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC2Q9BYS8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC2Q9BYS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC2Q9BYS8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC2Q9BYS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRRC2Q9BYS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC2Q9BYS8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC2Q9BYS8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC2Q9BYS8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms