Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC3Q9BY71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC3Q9BY71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC3Q9BY71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms