Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CADM1Q9BY67 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM1Q9BY67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM1Q9BY67 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms