Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNPY3Q9BT09 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNPY3Q9BT09 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNPY3Q9BT09 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNPY3Q9BT09 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNPY3Q9BT09 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms