Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA1CQ9BQE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA1CQ9BQE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA1CQ9BQE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms