Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC3Q9BQ90 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC3Q9BQ90 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC3Q9BQ90 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC3Q9BQ90 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC3Q9BQ90 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms