Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX50Q9BQ39 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDX50Q9BQ39 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms