Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF11Q99590 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF11Q99590 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SCAF11Q99590 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SCAF11Q99590 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF11Q99590 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms