Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1Q99536 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1Q99536 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAT1Q99536 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms