Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CICQ96RK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CICQ96RK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CICQ96RK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CICQ96RK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms