Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PANX3Q96QZ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANX3Q96QZ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANX3Q96QZ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANX3Q96QZ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms