Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALS2Q96Q42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALS2Q96Q42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALS2Q96Q42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALS2Q96Q42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALS2Q96Q42 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms