Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf49Q96NF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf49Q96NF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms