Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC136Q96JN2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC136Q96JN2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC136Q96JN2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC136Q96JN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms