Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS50Q96JG6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS50Q96JG6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS50Q96JG6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms