Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM5Q96HS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM5Q96HS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM5Q96HS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms