Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APIPQ96GX9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APIPQ96GX9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
APIPQ96GX9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APIPQ96GX9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms