Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BICD1Q96G01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BICD1Q96G01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD1Q96G01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD1Q96G01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms