Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC97Q96F63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC97Q96F63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC97Q96F63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC97Q96F63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms