Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3KBP1Q96B97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3KBP1Q96B97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3KBP1Q96B97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms